核酸計量技術為未來可(kě)能發生的公共衛生緊急(jí)核酸檢測需求提供計量技術儲備,可以大大提升核酸標準物質(zhì)定值準確度,擴展病毒核酸標物的覆蓋範圍。
生命科學的量(liàng)值以分子為最小單元,以(yǐ)物質的(de)量摩爾(mol)為基本單位,以阿伏伽德羅常(cháng)數(NA)來計算,1摩爾是精(jīng)確包含6.022 140 76×1023(約為6.02×1023)個原子或分子(zǐ)等基本單元的係統的物質的量(liàng)。從重新定義的國際單位製(zhì)布局圖來看,我(wǒ)們可以看出(chū)物質的量摩爾相對獨立。因此,在實際的生物計量研究中,一個核心的(de)挑戰就(jiù)是發(fā)展生物標準物質,實現生物檢測過程與國際單位的量(liàng)值溯源。
生(shēng)物計量
生物(wù)計量是計量科學領域的新成員,最(zuì)早的生(shēng)命科學研(yán)究僅限於現象和趨勢的觀(guān)察,最常回答“是什麽”的問題。然而,隨著分子生物學的發展,生物定量測量(liàng)變得(dé)越來越重(chóng)要(yào),大(dà)家開始關注“有多少”。目前,準確的定量(liàng)分析(xī)結果已經廣泛應用於臨床診斷、食品安(ān)全和環境檢測等領域,與人類的生產生(shēng)活密不可(kě)分。此外,生命科(kē)學相關技術的推廣應(yīng)用和產業(yè)發(fā)展催生了大量的計量需求:技術標準(zhǔn)化、產品質量、儀器校準(zhǔn)等(děng)。總(zǒng)體來說,如何結合計量科學的應用進行生物的準確測量是擺在計量研(yán)究人員麵(miàn)前(qián)緊迫而(ér)艱(jiān)巨的(de)工作。
生物計量學早在1999年第21屆國際計量大會就被提上日程。隨後,物質的(de)量谘詢委員會(CCQM)成立了生物分析工作組(zǔ)(BAWG)。該工作組的主要任務是建立生物技(jì)術可溯源測量(liàng)係統,優先考慮的是核酸(suān)測量、蛋(dàn)白質(zhì)測量及其(qí)方法、分析過程的標準(zhǔn)化以及標準物質(zhì)的研製,以便鞏固核酸和蛋白質測量的應用領域。核酸計量是生物計量研究的一個重要領(lǐng)域,是為了支持核酸(suān)測量的可比性、有效性和溯(sù)源性,最終使測量可溯(sù)源到國(guó)際單位製。目前,國際上從事核酸標準物質研製的機構主要有美國標準(zhǔn)技術研究院(NIST)、歐盟委員會聯合研究中心標準物質與測量研究院(IRMM)、英國政府化(huà)學實驗室(LGC)、德國聯邦材料測試研究院、澳大利亞國家測量院等。核酸計量的發展在中國同樣引(yǐn)起了很大的關注。中(zhōng)國計(jì)量科學研究院組建生物計(jì)量研究團隊(duì),取得豐碩的研究成果,多次參與或者主導國際核(hé)酸計量比對工作。上海市計量測試技術研究院(以下簡稱“上海計量院”)等計量機構則以(yǐ)地方產業需求為導(dǎo)向,搭建具有特色的核酸計(jì)量研究平台。
上海市計量測試技術研究院
病原微生物核酸檢測(cè)是預防病原微(wēi)生物(wù)侵(qīn)害,應對公共衛生事件的關鍵防線,而核(hé)酸濃度計量溯源是(shì)確保檢測結果準確、可靠的根本依據。當前,雖然以聚(jù)合酶鏈式反應(yīng)(PCR)為代表的核酸檢測方法(fǎ)發展迅速,但是完整的(de)計量溯源體係仍有欠(qiàn)缺,表現(xiàn)為(wéi)缺乏高水平(píng)絕對定量方法、尚無病原微生物核酸標準物質、尚依賴發達國家進(jìn)口、儀器計量(liàng)校準和試劑(jì)盒質量控(kòng)製受到阻礙等。總之,病原微生物核酸濃度量值在溯源到國際單位製(SI)的時候困難重重,影(yǐng)響了公共衛生安全領域核酸(suān)檢測的可(kě)靠性。
核酸計量溯源
核酸測量結(jié)果計量溯源是生物計量學科的一個重要領域,其目標是實現核酸濃度量值與國際基本(běn)單位(wèi)的鏈(liàn)接,確保每一個核酸檢測結果的準確可靠和等效一致。病(bìng)原微生物核酸檢測在公共衛生領域具有重要作用,可是長期以來,微生物核酸檢測領域(yù)的質量控製(zhì)依賴定性標準樣品居多,而定量標準物(wù)質非常少,並且由於核酸計量溯源整體研究(jiū)水平的(de)限製,缺(quē)乏高準確度核酸定量參考測量(liàng)方案,現有的標準物質也存在(zài)不確定度較大的問題。由於不確定的累計原理,最(zuì)終會影響公共衛生測量結果的準確性(xìng)。
● 質(zhì)粒DNA標(biāo)準物質
分子(zǐ)生物學技術(shù)為我們提供了分子製(zhì)造手段,又通過高準確度的參(cān)考定值方法,我們能夠獲得可靠的(de)濃(nóng)度(dù)量值,從而可以(yǐ)構建最高的生物計量標(biāo)準。例如,質粒DNA標準物質是一種含有檢測目的基(jī)因的特異性片段的重組質粒(lì)分子(zǐ),在PCR定性檢測中可以作為陽性(xìng)對照,在定量(liàng)PCR中(zhōng)可以作為定(dìng)量分析的標準品,構建定量分析的標(biāo)準曲線。在上海(hǎi)計量院,質粒(lì)DNA的定值采用了(le)3種方法以保證其量值的(de)準確性:紫外分光光度法、高分辨率電感耦合等離子(zǐ)體光譜分析(HR-ICP-MS)法、數字PCR技術。將這3種方法聯合起來給質粒DNA定值,可有效保障標準量值準確度性、溯源性。上海(hǎi)計量院先後研製了30種質粒DNA標準物質,其中有5種是國家一級標準物質。
2020年(nián),新型冠狀病毒(dú)肺炎疫情給核酸檢測帶來了巨大挑戰。新型冠狀病毒核酸分析以病毒RNA為測量目(mù)標(biāo),通過(guò)核酸含量檢測(cè)結果指導臨(lín)床判斷,其(qí)準(zhǔn)確性對(duì)疫情防控具有重要意義。作為(wéi)一種特殊的測量器具,必須通過計量溯源來確保其必要的測量能力。GB/T 21415—2008(ISO 17511)對體外診(zhěn)斷技術(試劑和(hé)器械)在(zài)測(cè)量生物量的(de)過程中所涉及的計量(liàng)學溯源性做出明確的說明:為了使檢驗(yàn)醫學量的測量得(dé)到正確的醫學應用,不(bú)論在何時何地都具有(yǒu)可比性,量必須有明確的定義,報告給醫生或者其他衛生(shēng)人員(yuán)及(jí)患者的結果必須準確(正確和精密)。
● RNA標準物質
為了給病毒核(hé)酸檢測提供可靠(kào)的計量支撐,上海計量院在(zài)上(shàng)海市科學技術(shù)委員會支持下,在上海市市場監督管理局協同指揮下,與上(shàng)海交通(tōng)大學及其附(fù)屬仁(rén)濟醫院優勢學科力量合作,啟動(dòng)了新型冠(guàn)狀病毒RNA標準物質研發項目,研究高準確度RNA數(shù)字PCR絕對定量方法,研(yán)製了兩種“新型冠狀病毒體外(wài)轉錄RNA標準物質GBW(E)091111/091112”,以新型冠(guàn)狀病毒E、N和ORF1ab三個(gè)基因為目標,涵蓋世界衛生組織(WHO)和中國疾病預防控(kòng)製中心(CDC)公布(bù)的關(guān)鍵檢測區域,利用體外轉錄方法製備,采用數字(zì)PCR方法對新型冠狀病毒RNA標準物質濃度進行測定。這(zhè)兩(liǎng)個國家(jiā)級病毒RNA標準物質可以為(wéi)病毒RNA檢測方(fāng)法研發提供靶標;可以直接用於質量(liàng)控製,對核酸試劑盒靈敏度、線性範圍以及靶向基因(yīn)區(qū)域等進行確認;也可以為檢測實驗室提(tí)供RNA陽性伴隨樣品,預警假(jiǎ)陰性結果的出現,為病毒RNA檢測提供量值溯源的“砝(fǎ)碼”。截(jié)至(zhì)目前,這兩個國家級病毒RNA標準物質已經向全國120多家單位提供樣品1300餘份,為疫情(qíng)防控作出多方麵貢獻,具體體現(xiàn)在以(yǐ)下5個方麵。
第一(yī),助力海(hǎi)關把好“國門”。根據2020年4月9日上海市新型冠(guàn)狀病毒(dú)肺炎疫情防控科技攻(gōng)關組會議精神,為支撐海(hǎi)關入境特殊場(chǎng)景需求,應海關衛生中心要求,上海計量院研製RNA標準物質100份,成為海關(guān)篩選合格試劑盒標準,提升了核酸檢測數據可靠性,為防(fáng)止境外輸入漏檢(jiǎn)提供了計量支撐。
第二,RNA標(biāo)準物質供給疾控、臨檢中心(xīn)以及醫院檢驗科作為陽性質控,驗證核酸檢測(cè)結果可靠性(xìng)。目前(qián)的應用單位(wèi)有武漢市疾(jí)病預防控(kòng)製中心、安徽省疾病預防控製中心、江西省疾(jí)病預防控製中心、重慶市臨床檢驗中心、上海市東方醫院吉安醫院(yuàn)、上海交通大學醫學(xué)院附屬瑞金醫院、複旦大學附屬中山(shān)醫院、中國科學技術大(dà)學附屬第一醫院(安徽省立醫(yī)院)、中國科學院大學寧波華(huá)美醫院等。
第(dì)三,在疫情發生第一時間為15所科研(yán)機構提(tí)供新型冠狀病毒RNA標準(zhǔn)物質,為(wéi)檢(jiǎn)測新方法建立提供了靶(bǎ)標,支撐國家和上海防疫科技專項,服(fú)務清華大學、上海交通大學、湖南大學等高校。例如(rú),湖南大學譚尉泓院士團隊成功建立了RNA分析方法並將成果輸出國外,對上海(hǎi)計量院研製(zhì)的標準物(wù)質給予高度(dù)評價。此(cǐ)外,上海計量院與上海仁度生(shēng)物科技有限公司合作承擔上海(hǎi)科委專項,研發唯一獲批的RNA高通量檢測方法。
第四,支持全國83家試(shì)劑盒生產企業,利用我院標準物質為生產線(xiàn)的標準(zhǔn)樣品賦值,從而滿足GB/T 21415要求,實現了試劑盒的計量溯源,提速試劑盒的注冊(cè),在試劑盒生(shēng)產管理過程中作為核查標準驗證產品質量。標準物質量值傳遞(dì)範圍覆蓋90%現有核酸試劑盒(hé)生產企業,如上海之江生物科技(jì)股份(fèn)有限公(gōng)司和上海捷諾生物科技有(yǒu)限公司。
第五,疫情期間,上海(hǎi)計量院為200家生(shēng)物檢測實驗室以及試劑盒生產企業提(tí)供計量器具校準服務,如針對PCR反應儀、微量核酸蛋白定量儀(yí)、生化分析儀、電解(jiě)質(zhì)分析儀、多功(gōng)能酶標儀、尿液分析儀、流式(shì)細胞(bāo)儀等。上海計量(liàng)院還為多家疾控中心提供新型冠狀病毒核(hé)酸檢測儀器校準,確保核酸檢測一線實驗室結果計量溯源。此外,上(shàng)海計量院為多家試劑盒(hé)企業開(kāi)展PCR校準服務,為上海地區企業的(de)產品緊(jǐn)急注冊提供關鍵計量溯源支撐。
上海計量院團隊還將持續開展病毒核酸(suān)計(jì)量(liàng)溯源(yuán)技術研究,擴展分子長度,提升靶向適用性(xìng);發展並優化高準確度絕對定量方法(fǎ),提升核酸標(biāo)準物質(zhì)定值準確度;擴展病毒核酸標物的覆蓋範圍,為未來可能發生的公共(gòng)衛生緊急核酸檢測需求提供計量技(jì)術儲備。
許麗,上海市計量(liàng)測試技術研究院高級工程師,主要從事核酸(suān)標準物質研製工作。
梁文(wén),上海市計量測試技術(shù)研究院高級工程師,主要從事核酸分析測試、數字PCR分析(xī)工作。
劉剛,上海市計量測(cè)試技術研究院教授級高(gāo)級工程師,主要從事生物計量、生物傳感研究工作。
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